Prosperdtxはデータサイエンスを活用して、パーソナライズされたヘルスケアをご家庭にお届け (2021/04/29)
Prosperdtxはデータサイエンスを活用して、パーソナライズされたヘルスケアをご家庭にお届け (2021/04/29)
昨年、社会的な距離を置くことが義務化されたことで、オンラインでの医療提供への関心が高まっています。ニュージャージー州を拠点とする新興企業Prosperdtx社では、個人に合わせた遠隔医療を提供するために、2つのコアサービスを用意しています。クラウドコンピューティングを利用して、さまざまなデータを1つの医療記録にまとめ、そのデータに対して機械学習による分析を行うことです。
遠隔地からの治療
現場ではなく離れた場所で患者の治療に当たる臨床医が増える中、患者に合った治療法を処方するために必要な情報をすべて揃えることは、解決すべき難問でした。
ProsperdtxのCTOであるZachary Wintrob氏は次のように述べています。「健康保険組合や医療ネットワーク以外では、どのシステムも相互に連携していません。薬局は、病院が見ているものを見ていません。主治医は、心臓専門医が見ているものを見ていません。誰も情報を共有していないため、すべての患者データがあちこちに分散してしまうのです」。
複数の医療データソースを単一の「縦断的な患者の健康記録」と呼ぶものに統合することは、2020年の創業以来、プロスペルトックスが行ってきたことの大きな部分を占めています。Oracle Cloud Infrastructure（OCI）上で動作する、新たに立ち上げられたデジタル治療プラットフォームにより、同社は医師、薬局、ウェアラブル、ラボからのデータ取得を支援するだけでなく、それらを分析し、利用可能な治療オプションや患者の潜在的な健康リスクに基づいた推奨事項を臨床医や患者に提供することも支援しています。
Wintrob氏は、「日常的な健康診断の大部分は、当社のプラットフォームを使って、どこからでもバーチャルに行うことができます」と語ります。患者さんが救急や手術のために病院を訪れる必要はありますが、医師や患者さんがアクセス可能な複数の医療データを1つのデジタル記録にまとめておくことで、血糖値のチェックや薬の投与量の管理など、日常的なモニタリングを遠隔地で行うことがより現実的になります。"また、医療システム全体が解放され、クリティカルケアに重点を置くことができるようになります」と語ります。
Wintrob氏は、ソフトウェアアーキテクトとOCIに関する技術的な会話を収録したビデオシリーズ「Built and Deployed」のエピソードの中で、自身のクラウドへの取り組みについて語りました。
データサイエンスが秘訣
この新しいデジタル治療プラットフォームを実行するために、WintrobのチームはOCI Data ScienceのPython Notebookを使用し、Oracle Autonomous Data Warehouseでクエリを実行し、因果推論モデルを使用して分析を構成しています。「そこに秘密のソースがあるのです」とWintrob氏は言います。Prosperdtxは、出版された文献、ゲノムベンダー、電子医療記録（EMR）から得たドメイン知識を取り入れ、それらを医師の入力、治療履歴、意思決定ロジックと組み合わせます。最終的には、様々な仮定の妥当性を迅速に評価し、臨床医とその患者に提案を行います。
患者さんは、遠隔地からEMRシステムにログインすることができます。医療機関がProsperdtxを提供している場合は、サインアップして、医療記録や外部ソースからデータを取り込み始めることができます。
「患者がウェアラブルデバイスを同期し、先祖代々のDNAプロファイルとリンクし、現在および過去の医療機関のリストから選択すると、それらのデータをすべて縦断的な患者記録として構造化することができます」とWintrob氏は言います。
Prosperdtxプラットフォームは、患者がすべての健康データを接続すると、それをOracle Autonomous Data Warehouseに取り込み、EMRデータに使用される共通のデータモデルに構造化します。医療業界の相互運用基準に準拠していないウェアラブルデータや先祖代々のDNA記録であっても、Autonomous Data Warehouseに取り込まれ、患者の記録と統合されます。
「OCI Data ScienceとOracle Autonomous Data Warehouseを組み合わせることで、患者に特化したレベルで掘り下げて洞察するために必要な変数を得ることができました。これこそが真の個別化医療の実現なのです。」とWintrob氏は言います。
OCI Data Scienceに組み込まれているPythonツール（数値計算用のNumPyやデータの可視化用のPandasなど）に加えて、Wintrob氏のチームはOracle Applications Express（APEX）を使用して、プラットフォームをクラウドネイティブアプリケーションに変換しています。Wintrob氏は、「オラクルのWebインターフェイス上のローコード環境は、我々に大きな力を与えてくれます」と語ります。"ほんの一握りの人間しかいない小さな新興企業にとって、膨大な努力や膨大な予算をかけずに立ち上げることは非常に大きな意味を持ちます」と言います。Wintrob氏のチームは、パンデミックの発生と同時にクラウドの運用を開始しました。「パンデミックが始まってから、ウィントロブのチームはクラウドでの運用を開始しました。」
Wintrob氏は他のクラウドベンダーも検討しましたが、「私たちが行っているような仕事を実装するためのリフトは高すぎました。我々よりもはるかに大きな開発チームが必要でした」と語る。オラクルが提供するローコードでハイパフォーマンスなクラウド環境に加えて、Wintrob氏はクラウドのリソースを簡単にプロビジョニングできることも重要なポイントだと指摘する。
「オラクルでは、どのような仮想マシンが必要か、どれだけのRAMや処理コアをプロビジョニングするかなど、ほとんど考えることはありません。最小限のスペックでシングルコアのプロセッサをプロビジョニングし、Autonomous Data Warehouseをオートスケールに設定すれば、すぐに使用することができます。ワークロードがより多くのコンピュート、メモリ、ストレージを必要とする場合、私は簡単に上限を設定することができ、OCIは私が何も言わなくても自動的にそれらのリソースをプロビジョニングしてくれます」。
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